水豆一里浩(上野下野配音)和结女一里浩是在同一所初中就读的同学。在学习期间,他们建立了一种纯粹的关系。然而,在短暂的恋爱之后,由于一些误解,这段关系最终结束了。
幸存的人们建造了三堵巨大的防护墙,以防止巨人的入侵,并在这个与世隔绝的环境中享受了百年的和平。然而,作为“和平”的代价,人类已经失去了走出围墙的“自由”,像圈养的动物一样平静地生活。主人公艾伦·耶格尔对他尚未见过的外部世界感兴趣,但也渴望人类失去的“自由”。与大多数害怕巨人、盲目相信墙可以保护自己的安全并愿意在墙内生存的人类不同,他探索墙外世界的想法被认为是异端。十岁那年,当人们已经安逸了100年的时候,艾伦·耶格尔突然出现了一个前所未有的60米高的“超级巨人”,以压倒性的力量摧毁了城墙。之后它立即消失了,巨人们成群结队地冲进墙里捕食人类。
数千年后的未来,进入宇宙空间的人类,被分为银河帝国与自由行星同盟这两个拥有“专制政治”与“民主主义”两种不同政治体制的国家。两国之间的抗争持续了150年,以无边无际的广袤银河为舞台,重复着无止境的战斗。