21世纪,地球恢复了往日的平静,但此时,一颗陨石从宇宙中坠落,陨石上有一个人造的时间胶囊。地球和平联盟TPC的GUTS团队通过时间胶囊了解到,地球上将发生重大灾难。
季節は秋になり、結城理をはじめとしたペルソナ使いたちによる特別課外活動部と異形の怪物「シャドウ」との戦いにも、終わりが近づいていた。しかし、「影時間」を終わらせるためシャドウとの死闘を繰り広げる理の前に、謎の転校生・望月綾時が現れる。第3章監督は「銀河機攻隊マジェスティックプリンス」「デート・ア・ライブ」などを手がけてきた元永慶太郎。
少女们投身战斗 为了重要的同伴! 一直在相互争斗、来自5个异世界的来访者「Z/X」缔结了休战条约,人类因此回避了灭亡的危机。 主人公·各务原安昙接受青之世界的命令,与成为其搭档的Z/X·利盖尔一同前往新设的女子学校「富士御崎学园」。