在日本室町时代中期,执政幕府的权威急剧下降。野心勃勃的Keiko Tetsuke(中井圭一饰演)为了实现自己的霸权,将自己未出生的儿子Baigui Maru献给了48位魔神。他与怪物们达成协议,拿走了48个器官,包括眼睛、耳朵、嘴巴、鼻子等。
御茶水工业大学生早乙女和也,因恶友南原耕太郎的阴谋赠送的病毒CD发作、试图抵抗之下,居然莫名奇妙的连结到生化达因公司网站,还误订了生化娃娃(Cyber Doll,简称CBD)。快递员送来了生化娃娃小梅,开启了和也与小梅的故事。
惊慌失措的佐治不知如何是好,于是来到酒