故事发生在江户时代末期，雾日（森高冈饰演）偶然遇到了孤儿女儿朝雾（安田裕实饰演），并将她带回妓院，训练她成为一名流浪女子。超武曾经受到母亲的虐待，身上布满了樱花形状的疤痕。然而，不幸的是，他因其独特性而受到客人的喜爱。
个性活泼开朗有时候显得有些大大咧咧的水无月遥（田村由加莉 配音）、成熟稳重颇具大小姐风范的神无月葵（能登麻美子 配音）、从意大利转学而来的天才少女叶月胡桃（钉宫理惠 配音），活泼可爱的三人平日里在学校中是无话不谈的好友，过着平凡的校园生活，但每当夜晚来临，她们便会变身成为拥有超能力的魔法少女。 三人的目标，是寻找价值连城的天使像，邪恶而又贪婪的地下拍卖组织Black auction得到了它，企图通过它来牟取暴利。成绩优异的学生会长如月唯人（桧山修之 配音）、随叫随到的万能管家长月平之丞（清川元梦 配音），是他们在背后默默的支持着少女们。
