一次偶然中，卡尔迪娅邂逅了名为罗宾（前野智昭 配音）的大盗，开朗乐观过于自信的他并不害怕卡尔迪娅身上的剧毒，两人结伴而行，前往伦敦，在那里，隐藏着卡尔迪娅的身世之谜。 一路上，卡尔迪娅和罗宾遇见了形形色色的同伴们。吸血鬼猎人范海辛（诹访部顺一 配音）、智商超群冷静和善的弗兰肯斯坦（柿原彻也 配音）、有些轻浮但拥有超高智商的巴比康（森久保祥太郎 配音）。
市建龙园高级中学又迎来了一个和平祥和的日子。一位名叫Lumu Yuan（由Yumu Bi配音）的大二女生和她的朋友Sayega美树（由Hidamura秀吉配音）和仁美智珠（由Shinagai Ryoko配音）讨论浪漫话题，享受年轻女孩的快乐青春。就在这时，一个叫小美彦（斋藤千和配音）的新生来到了班上，这个带着一丝神秘气质的女孩让小圆相当困惑。在和Sayega一起放学回家的路上，小圆听到了一个浑身伤痕累累的未知生物的呼救声，而正是严小美在追赶它。在关键时刻，他们得到了魔法女孩巴玛米（水桥翔之配音）的帮助，巴玛米也是神奈原高中的学生，并了解到这个名叫丘比的生物有能力帮助人们成为神奇的女孩。女孩们无意中打开了通往另一个世界的大门。。。这部电影是《魔法女孩》的剧场版，分三部分上映，由电视版12集改编而成。
故事发生在位于东京的全力高中内，该校的棒球队拥有史无前例的弱小实力，屡战屡败，每次联赛都是垫底的那一个。长此以往，校长终于对无能的棒球队和球队教练不屈斗志（玉山铁二 饰）下达了废部警告。
