出生在海里,守护着大海,走向大海——那就是蓝色的美人鱼!为了维护海洋安全,专业的“蓝美人鱼”进入了位于山本的横须贺女子海洋学校。她被任命为“春日”号巡洋舰的船长,并与同学一起参加了一次海上实习。
在一列从东京开往大阪的特快列车上,坐着一位尊贵而特殊的客人。她是来自欧洲英格拉姆帝国女王莎莉贝丝,随行的还有其年幼的儿子菲利浦王子。女王拥有一颗欧洲最大的宝石——水晶之母,这也引起了怪盗基德的注意。
来自异次元的种族MU占领了东京,并将城市隐藏在巨大的防护壁之后,他们欺骗在东京生活的人们他们已经成为世界上仅存的人类。在防护壁之外,名为“TERRA”的反MU组织声势渐渐壮大。