被视为绑架犯而受到警备局追捕的这名男子，委托十三保护他所绑架的一名小孩。十三究竟会决定怎么做？由飘荡硝烟味的枪口所道出的科幻硬汉漫画在此开幕！！
德川幕府倒台，日本进入开明的民主时代。但是明治时期政府、军队及至商贾仍存在腐败贪婪的现象。明治八年爆发血税暴乱，小学教师鹿岛刚（大門正明 饰）携家眷旅行途中遭到暴乱农民的袭击，鹿岛和儿子司郎（内田慎一 饰）惨遭杀害，他的妻子小夜（赤座美代子 饰）则被暴民侵犯。在此之后，小夜瞅准时机杀死一名暴徒，入狱后她与狱警、官员私通，千方百计产下一女，取名雪姬，并将为家族复仇的使命交给女儿。狱友同情小夜的遭遇，想尽办法将雪姬托付给武功高强的僧人大臣道海（西村晃 饰）修行。20年后，背负着莫大仇恨的修罗雪姬（梶芽衣子 饰）携着血雨腥风来至人间…… 本片根据小池一夫（漫画脚本）和上村一夫（作画）的漫画原著改编，主题歌后被昆汀·塔伦蒂诺用到《杀死比尔》中。
在新的故事中，神秘动物学的组织“皇帝组织”将勇敢面对这只巨型怪物，强大的哥斯拉也将与门兹拉、拉顿及其死敌基多拉三王展开激烈对抗。当这些传说中的超级生物再次崛起时，他们将进行皇室斗争，人类的命运岌岌可危
