为了防止基德得手,女王身边布置大批保镖和警力。中森警官是日本警方的总代表,而他的女儿青子以及基德的真身快斗也同在这列火车之上。 眼看离预定时间越来越近,快斗却始终没有找到宝石真正的藏匿地点。与此同时,国际宝石大盗杰卡尔和罗丝也尾随前来,他们企图在基德得手之际趁火打劫。同在火车上的柯南从伪装成乘务员的罗丝身上看出蹊跷。一场宝石的攻防战随即展开……
六年级时,由于父亲的工作调动,小岛洋子(福井文雄配音)进入了大黑市的一所小学。和她一起出现的还有她的妹妹恭子(由矢岛恭子配音)和她的宠物狗佐助。在学校里,她遇到了与她同名的文惠(小岛由子配音)、勇子(桑岛法子配音)和元贤(朴罗美配音)等人。后来,洋子加入了学校的计算机侦探局。在看似普通的电脑眼镜背后,隐藏着一个谜,侦探团队已经开始了一场与技术的大战。