一名普通高中生佐藤由纪收到了一封来自一款闻所未闻的应用程序“达尔文游戏”的电子邮件。该应用程序是在一款游戏中推出的,玩家参与了一场由电力驱动的战斗。
在一列从东京开往大阪的特快列车上,坐着一位尊贵而特殊的客人。她是来自欧洲英格拉姆帝国女王莎莉贝丝,随行的还有其年幼的儿子菲利浦王子。女王拥有一颗欧洲最大的宝石——水晶之母,这也引起了怪盗基德的注意。
很久以前,在无人居住的山区,建立了最新的人类研究中心。有一天,用于研究的主计算机突然意识到了这一点,并勃然大怒。人类不知疲倦地工作以防止暴乱并恢复和平。。。