公元2010年。全球规模的“超级飓风”使世界各国遭受了巨大的损失。已经膨胀到80亿的人口一下子减少了50亿，变成了30亿。经济和军事的均衡随之崩溃了。 北美、俄罗斯、北欧被冰雪覆盖，平原地区沉入大海，世界地图突变，混沌时代来临了。
高度发达的工业文明最终带来了灾难，长达7天的虫族毁灭战争摧毁了人类文明。一千年后，工业文明留下的问题继续困扰着这个星球。毒性强的植物形成了一片令人生畏的“腐生海”森林，随着时间的推移，腐生海有序扩散，吞噬了周围的世界。
一名普通高中生佐藤由纪收到了一封来自一款闻所未闻的应用程序“达尔文游戏”的电子邮件。该应用程序是在一款游戏中推出的，玩家参与了一场由电力驱动的战斗。
