故事发生在御伽学园里,大神凉子(伊藤静 配音)是一个身材娇小但个性十分凶悍的傲娇少女。在学园中,有一个名为御伽学园学生互助协会的神秘组织,而大神正是其中的一员。
幼时曾深陷绝望深渊的直枝理树,与4位少年少女相遇了。 在那之后数年,理树作为Little Busters的一员,喧闹地过着快乐的每一天。 这样的时间能够一直持续就好了。理树所期望的只有这样。
Masamu Shin(Kami Kazuya饰演)是一个非常普通的年轻人,从小就没有太多运气,总是被女人讨厌。一天,一个自称是神的人(山下正史饰演)出现在阿城面前。