电影版《游戏王》改编自日本家喻户晓的纸牌游戏和电视卡通片，故事的小主人公武藤游戏是一个对纸牌游戏走火入魔的高中男孩儿，与怪兽斗争是他肩负的最大使命！ 看似简单的纸牌游戏，背后的真相永远比我们想象要复杂得多，它蕴含了能够改变历史进程的古老神秘力量！在埃及沙漠的深处，一个古老的恶灵被重新唤醒：几百年前被武藤游戏神秘的第二个我--“法老王”打败的亡灵之神重返人间，他要彻底打败武藤游戏并成为全世界的主宰！游戏和他的朋友们是否能在地球被沙漠吞噬之前击败强悍的亡灵之神？看似儿戏的纸牌游戏真的是拯救世界的最后希望吗？
时间来到最终决战的两年后，在本应已迎来和平的地球上，怪兽们再度倾巢而出。 与此同时，世界各地相继发生了各种入侵超古代遗迹的事件。而GUTS-SELECT（精英胜利队）也迎来了新的队长——时冈（中村优一 饰），众人开启了调查。
橙色头发的男孩黑崎一护是一名有着强烈正义感的高中生。他与父亲和两个姐妹住在一起，从小就能看到鬼魂，但他并不把它当回事。一天晚上，一只名叫“旭”的怪物袭击了一护和他的家人。
