一天,致力于研究化学中神秘物质X的Kazuki博士与他的助手和儿子Ken一起发现了一种新物质Z。这种物质在东京发射白光和黑光。这道白光击中了三个女孩,Aki Mura、Haodeshi Mura和Matsuhara Mura,她们是初中一年级的学生。结果,三名飞行女警官诞生了!!与此同时,黑光袭击了东京动物园。猴子山上的一只猴子成了飞行女警察的敌人。女警察将如何保卫这座城市
新闻报道了怪盗团事件嫌疑人的莲自杀的消息,同时怪盗团也开始暗中展开行动。 为了揪出策划所有事件的幕后人物并让其改过自新,怪盗团决心潜入新目标的魔宫,并盗出宝物。