在GPS和金泽军团激战之后,铃木高中进入了短暂的和平时期。Kenzawa Tomohiro(山田隆吉饰演)放弃了王位,而Ryuta Genji(小林隆史饰演)继续对可怕的Hye Lam(森森饰演)发动攻击。
有一天,当丹佛变得无法控制时,塔洛妈妈向水口龙太郎寻求帮助。当龙太郎的姐姐松本美丽在丹佛时不幸遭到袭击时,发生了一起事故。事实上,似乎是Yuto(中村裕一饰)操纵了这起事件。
某日,一群使用风遁之术的空忍空袭火之国,无数民众和忍者遇害,形势危急。据纲手大人所言,这群不速之客正是在第二次忍者大战中落败的空之团,如今他们怀着复仇之心再次出现。