故事告诉男主角小山武史进入前女子学校Dairi school的故事。在学校的这个女性花园里,小山武正在等待能干的青梅竹马兼学生会副会长、女主人公谷加秋拉、骄傲的小姐神木玲和非常可爱的未婚妻千叶瑞穗。作为庆祝“宠物精灵”系列25周年的纪念活动之一,神奇宝贝公司将于2021 9月9日起推出一系列新的动画作品“宠物精灵的进化”。故事舞台将横跨神奇宝贝世界的八个已知区域,讲述八名玩家的故事,他们熟悉不同信仰和欲望的人。