德川幕府300年统治期间，佐渡出产的金银是政府财政的重要保证，被世人称为“御用金”。金子经过加工，经过千辛万苦才能运到江户，但在三天的路程中，暗礁狂流成为威胁运金船只的主要威胁。
柯南在规定时间内将他出给众宾客的难题破解，被获准和小兰一起参观陈有他设计图的展览馆，交谈中，他感慨30多岁初成名时的作品不够对称称不上完美，并从小兰口中打探到她要与新一在米花大楼约会为新一庆生的诸多细节。 不久，柯南连接数通向新一挑战的电话，对方均告知他已在某地放置会在某时爆炸的炸弹，柯南将危机一一化解后，开始与警方、毛利一起分析到底是何人所为。电视报道其中最为轰动的爆炸案时，柯南由画面联想到所有炸弹放置的地点附近均有森谷帝二自认不完美的作品，心中一惊。众人拜访森谷帝二时，柯南暗中将他的宅邸查看，找出凶犯正是他的证据，原来他是狂热的完美主义者，想亲手毁掉年轻时因妥协设计出的不绝对对称作品，并借机报复没令他的宏伟设计夙愿在西多摩市达成的新一。被抓一刻，森谷帝二的冷笑令柯南醒悟：米花大楼亦是他不完美的作品，小兰正在那里等新一赴约。
为了弄清真相，悠真带着几个朋友回到村里。最终 不仅悠真失踪了，他的朋友们在村子附近也离奇遇害。 这个村庄本应在水 坝建设后消失，隧道出口都封闭了。森田奏意识到父亲似乎知道背后的故 事。还有一个神秘人，仿佛可以解开谜团。而犬鸣村的诅咒才刚刚开始。
