由于“正体不明的烟雾”而变成“无法死去”之身的小林, 期盼着自身的死,拒绝与他人的接触。 对于这样的他的存在怀有兴趣的花崎向他提出“要不要加入‘少年侦探团’?”…… 小林与花崎。他们的相遇, 终将与世纪的犯罪者怪人二十面相和明智小五郎的因缘相互交错, 并推动两人的命运……由于能够看到妖精的独特体格,年轻女孩莉迪亚(奈良水树配音)经常受到同伴的排斥和孤立。然而,即便如此,莉迪亚仍然决定利用自己的能力成为一名专门处理人类和地精之间事务的地精医生。