只有解决事故的关键点，时间才能顺利度过。在遭遇车祸后，住在北海道的母亲来到了吴的公寓。然而，不久之后，她的母亲被进入房子的人杀死了。吴在躲避警方追捕时进入“重新释放”，但意外地在1988年回到了小学。当时，同一个名叫初月家代（铃木丽阳饰）的小镇被一名连环杀手杀害，而吴最信任的哥哥白鸟润（林卓度饰）成为嫌疑人。仿佛是为了防止悲剧发生，吴回到了所有悲剧的起源
游戏以前作 2 年后的日本乡村小镇“稻羽市”为舞台，玩家将扮演刚转学到稻羽市八十神高中 2 年级的主角，在追查神秘连续杀人事件时，潜在的“PERSONA”能力觉醒，同时也开启了进入异世界的大门，与其他 PERSONA 召唤者一同挑战神秘的迷宫。 游戏承袭前作的基本系统并加以强化，结合校园冒险与迷宫战斗 2 大部分。冒险部分将让玩家体验与形形色色的夥伴结交与互动的过程；战斗部分则让玩家与夥伴组队深入本作全新登场的乱数产生迷宫，发挥各自的 PERSONA 之力对抗异世界的神秘怪物。
