某日,野原新之助(矢岛晶子 配音)正在公园里和风间(真柴摩利 配音)、妮妮(林玉绪 配音)等朋友们玩耍,意外遇见了一位名为金有久美子(钉宫理惠 配音)的神秘女子,久美子告诉小新,自己来自于遥远的未来世界,而彼时已经长大成人的新之助,正是自己的未婚夫。 跟随着久美子,小新一行人来到了未来,在那里,金友电机的社长,亦是久美子的父亲金有增藏手握大权,并且绑架了一直和自己作对的新之助。得知小新的到来会阻碍自己的计划,增藏派出了刺客,在强大的敌人面前,小新能否顺利救出新之助,并且帮助面前这个陷入了黑暗之中的世界重新找回光明呢?
正当他准备当场死去时,出于某种原因,他睁开眼睛,发现自己穿越了12年前。穿越时空,重回人生巅峰——12年前的初中。。。为了拯救女友,改变从那以后一直回避一切的自己,武藤决心踏上一生的绝地反击之旅。