《游戏王-怪兽之决斗》改编自漫画《游戏王》,于2000-2004年之间在东京电视台播出。故事以漫画剧情为主,但因为中途漫画故事情节进度跟不上,故加插大量漫画没有的剧情和人物。此举为脱离“原作”独立创作故事奠定下基础。
日本科学技术大学的教授上田次郎(阿部宽饰)主攻物理学。他向全日本的超能力者发出挑战,“如果能在我面前证明超能力的存在,将获得奖赏”。这一广告,吸引了落魄的魔术师,曾经日本第一魔术师山田刚三的女儿,山田奈绪子(仲间由纪恵饰)的注意。
自己的阳台栏杆上出现了像被单一样挂在上面的少女,这种非现实的情节出现在了上条当麻的眼前。虽然在这个城市——最先进科学引导的学院都市中,超能力已经可以通过科学技术创造出来,但是眼前这位自称“茵蒂克丝”的少女还是把上条当麻吓了一条。