故事内容延续第一部TV版攻壳机动队STAND ALONE COMPLEX的剧情继续发展。但TV版的2部作品与剧场版无甚联系，可以看做是两个平行世界里发生的事情。 这次TV版第2季的制作班底与第一部相同，同时剧情表达上和第一季一样，每话由不同故事构成，各自独立成章，却贯穿着同一条主线。在剧情上同时电影版导演押井守也参与了协力，不过电影版中凄凉的气氛没有在TV版第二季中体现。
在公司的更衣室里，我们在工作前与我们的年轻一代沙英、在公司工作了8年的小凤和在公司工作10年的久木进行了各种各样的讨论。
秀一发现，母亲似乎有某种隐忧而不愿将曾根赶 出家门，另一方面，曾根好像又对遥香心怀不轨。对继父心存愤恨的秀一无计可施，于是通过网络购买碳酸钾，决定将曾根杀于无形。他的计划顺利实施，但他本人也越陷越深…… 本片根据貴志祐介同名小说改编。
