2048年,经过中央政府管理的人工智能筛选,一部分人类登上星际迁徙飞船“阿拉姆”,前往11.9光年外的鲸鱼座τ星E的旅程。然而,人类花了20年时间到达的这颗行星与地球之间的环境差距远超预期,使其不适合人类生存。移民飞船上有一个叫庆雄的年轻人。4岁时,他目睹了自己的父母被哥斯拉杀死。20年来,他一直想回到地球,摧毁哥斯拉。移民的可能性已经消失,飞船内部的生活环境变得越来越恶劣。以Haruhiro为中心的“重返地球派”已经成为主流,他们决定通过危险的长途子空间航行重返地球。然而,经过2万年的进化,地球已经形成了以哥斯拉为顶点的生态系统,完全成为了一个未知的世界。人类最终能夺回地球吗?庆雄的命运会怎样?
他的不满导致了意想不到的灾难,不仅面临着道场被关闭的命运,还遭到了学生会派出的精英部队的追捕。正当她的生命危在旦夕时,一个名叫Ryusheng Shibing Wei(Yuki Bi配音)的红发女孩突然从空中坠落,击退了敌人。随后,一批乌江女孩,包括柳生优信(由苏原秀吉配音)、增田幸村(由Naomiya Rihui配音)、后藤有炳伟(由小林优配音),在宗朗身边相继出现。
在都内的某所高中,某天转入了两位转学生。她们是认真而天然、无法判断其言行的洲崎绫,以及展露天真烂漫的笑容、发呆吐槽皆有所长的西明日香。时而困惑时而爆笑,明日香和绫今天也度过快乐的一天。