故事发生在日本江户时代,当时一名神秘男子出现在武士桂(石田明配音)面前。他手里拿着魔剑“红樱”,要求对其进行测试。当晚之后,桂的下落不明。桂的宠物伊丽莎白(高松伸树配音)从万石屋找到了信高(Naomiya Rihui配音)和信矢加(Sakaguchi Daisuke配音),并委托他们寻找主人的下落。与此同时,银石(杉田智和饰)也被委托寻找调皮捣蛋的红樱的下落。三人的线索聚集在一艘飞艇上,由于远离警方的管辖范围,飞艇内的邪恶势力被完全隐藏起来。在那里,银石遇到了他的前战友、现任对手高崎信三(由齐安武史配音),他正带领他的幽灵军队试图摧毁江户。一边是令人发指的恐怖分子,另一边是残忍嗜血的妖刀红鹰。身受重伤的银石能否安全逃生,拯救江户?这部剧场版翻拍了《银魂》动画中的《红樱物语》,没有出现在原作中的真选组也将在故事中展示他们的技巧。
鈴木央のマンガをもとに、7人の大罪人により結成された“七つの大罪”が世界の危機に立ち向かう姿を描く本シリーズ。劇場版第1弾と同じく、鈴木による完全新作オリジナルストーリーをアニメ化した本作では、テレビアニメから続く“最終章のその先”が描かれる。
2002年日本发生多宗奇怪的人口失踪案,记者城户真司为了调查此事,便到其中一个受害者榊原耕一的家中调查,期间他发现了一个咭盒,後来真司意外地藉咭盒的力量变成为幪面超人龙骑,并认识了另一Rider秋山莲(幪面超人KNIGHT)和神崎士郎的妹妹神崎优衣。真司当Rider的目的是保护人类和阻止Rider之间的战斗,相反不喜欢战斗的莲为了救爱人,而被逼与其他Rider战斗。随著其他的出现 ,Rider的战斗渐渐变得激烈,即使真司拼命阻止,但战斗的牺牲者仍来陆续出现。 就在Rider之间的战斗发展到後期,真司赫然发现神崎士郎发起Rider之间的战斗的原因拯救优衣 。原来优衣在小时候已死去,现在优衣的生命是由镜世界的优衣给予的,而这生命在20岁便会用尽,优衣亦会消失。早就得知此事的神崎士郎希望将最後Rider的生命给予优衣,所以便发动Rider之间的战斗。真司知道唯一可以救优衣的方法便是战斗,所以他便要在阻止战斗和拯救优衣之间作出选择。另一方面知道了哥哥的目的的优衣,为了阻止战斗甘愿放弃新生命,并在神崎士郎面前消失。受到优衣的影响,真司决定继续为保护人类而战,可惜最後他为保护一个女孩而被怪物袭击伤重而死。莲则成为最後Rider,成功令爱人苏醒,而自己却伤重而死去。 战斗结束後,神崎士郎重回过去,再一次发动Rider间的战斗,但被优衣阻止。最後神崎士郎返回过去,令Rider之间的战斗不再发生,所有人都各自过著平凡的生活,而优衣亦已经在小时候就死去。