故事发生在一所偏远的私立巴光学校，该校一直以严格的校风和培养真正的女士而闻名。然而，自2011年4月以来，该校从单纯的女子学校转变为男女混合学校，五名不“高尚”或“纯洁”的男生第一次踏上了这片从未被“污染”的“圣地”。
最终，KIVA-LA一剑刺穿了Decade……各骑士的世界恢复了原样，但Decade的世界却消失了。哀伤的众骑士一起回忆与士并肩作战的日子，而此时，过去的士从各人的回忆中复活！另一方面，超级死神博士与佐鲁大佐、蜂女共同组建超修卡，并制造出Neo生命体杜拉斯…… 第二部分：假面骑士W ～Begins Night～ 鸣海侦探事务所这次受“风都”人气歌手安纱美所托，负责调查安纱美亡姐突然出现的不可思议事件。在调查过程中，已去世的前所长鸣海庄吉竟然出现在翔太郎他们的面前，并变身为假面骑士Skull与之战斗。在与庄吉战斗的时侯，翔太郎逐渐回忆起庄吉逝去的那一夜，也是他与菲利普共同成为W的那一夜…… 第三部分：MOVIE大战2010 Decade与W命运般地相遇，并与全平成骑士一同对战超修卡的巨大要塞！
