在与戈鲁戈姆战斗后半年,本应取回的和平突然被怪魔界克萊西斯帝国打破。克萊西斯帝国的杰克将军想拉拢南光太郎作为部下,但光太郎不答应,于是杰克将军便将其变身机能破坏。 变身机能破坏的情况下,光太郎被扔往宇宙。暑假结束时,当时正在学习的五位朋友,森谷信长(前松义弘配音)、加泽秀吉(田坂秀吉配音)、东吉(Hato Yoshiko配音)和椎名林沙(Yoshihiri Yanzoo配音),相约来到望月书院长达三年的分离期,寻找他们当年埋葬的时间胶囊。