对这一切漠不关心的若叶，竟然有一天看到了一个球状的奇怪生物，并给它取名为小波（森千早配音）。没想到，乖巧调皮的小博竟然拥有对付恶灵的神奇能力，这对若叶帮助很大。另一方面，Daijo饰演的超自然宅女Donglio（由Hato Mae配音）声称不相信超自然现象，在一次偶然的机会下转到了若叶的班级并与她成为了朋友。两个曾经孤独的女孩成为了朋友，在小博的陪伴下，她们也将经历许多惊心动魄的精神体验。。。这部电影改编自艾斯·连杰的原作。
麻辣教师鬼冢英吉（反町隆史 饰）受邀来到北海道的一个美丽古朴的小镇——幌比内，在北文馆学苑2年C组担当为期三周的代课老师。时间虽短，却问题多多。
並由地球統合軍將其改造成為全長1200公尺的超大型主力戰艦，命名為「馬克羅斯」（MACROSS，德文「大宇宙」之意）。其間人類卻也歷經統合派與反統合派國家陣營的分裂，在綿延的爭戰中馬克羅斯的改修則仍然持續著。直到10年後，在馬克羅斯舉行正式起用下水典禮的當天，在月球軌道附近突然發現有大規模的時空跳躍反應。而此時馬客羅斯艦上的主炮竟自動發射，並擊中在月球出現的外星艦隊觀測艦！事已至如此頓時成了趕鴨子上架，不把對方惹毛才是怪事……於是統合軍只好展開接戰，並讓馬克羅斯升空啟航，以轉移敵方注意。青年一條輝陰錯陽差的坐上了統合軍的戰機捲入戰鬥，並救起了一位名叫林明美的少女，且與艦上女軍官早賴未沙的不吵不相識……被稱為「第一次宇宙大戰」的這場人類對異星人的戰爭就此揭開了序幕。而圍繞在輝、明美與未沙之間的感情糾葛，卻也開始介入了戰事的發展之中，甚而成為主導後來歷史走向的契機……
